第二集(jí )中，尼奥（基努·里(lǐ )(📼)维斯(sī )(🏽) Keanu Reeves 饰）没有能从内(nèi )(🥈)部摧毁“母(mǔ )体”，他的身(😧)体在真实世界的飞(fēi )(❣)船上陷(xiàn )于昏迷，思想(xiǎng )(🐿)却(🕔)被困(kùn )在介于“母体”和真实(shí )(💆)世界(🔲)的(de )中(zhōng )间地(🏐)带，这(zhè )(🕌)个(gè )地方由“火(🗑)车(chē )人”控(kòng )制(😻)。墨(🖍)菲斯(sī )（劳伦斯·菲什伯恩 Laurence Fishburne 饰）和崔(🥔)妮蒂(🗞)（凯瑞-安·莫斯(sī ) Carrie-Anne Moss 饰）等(🤲)人知道(😍)了尼(👺)奥的(de )情况(kuàng )，在守(🐀)护天使的带领(lǐng )下， 找(🤘)到了(❕)“火车人(rén )”的控制者梅(méi )罗纹(🦇)奇，经过一番激斗，将(🥋)尼奥救了出来。　　此时，电子乌贼(zéi )部队对(🤔)锡安发起(🤥)了猛烈的攻击，人类(lèi )组(♌)织所有(🐞)机甲战士展开顽强的抵抗，形势危在旦(🔥)夕(🚡)；尼奥和(hé )崔(🚽)妮(nī )蒂(dì )驾(jià )驶了一艘飞船(📤)克服重(chóng )重困难(🛃)，到(dào )达机(💅)器(qì )城(chéng )市(📬)，尼奥终于见到(🚩)了机器世界(jiè )的(de )统治者“机器大帝”，双方谈(tán )判并达成了(👼)协议：(⛅)尼(ní )奥除(chú )掉不(🙅)受“母体(tǐ )”控(🚓)制的(de )(🐇)史密斯，以换取锡安的和平。　　在(zài )“母体(tǐ )”中，尼(ní )奥和史密(🍏)斯(sī )(😻)展(zhǎn )开了关系人类生死存亡的(🐼)最后(⛱)决(jué )斗。